Otsuki liegt im äussersten Südwesten der Präfektur Kochi auf der Insel Shikoku. Otsuki grenzt im Norden an Sukumo und im Osten an Tosashimizu und grenzt im Süden an den Pazifischen Ozean. Im Süden hat Otsuki eine kleine Ansammlung von Inseln, darunter Kashiwajima, Okinojima und Ugurushima.